- Alternativa sökord
Salmonella, Shigella, EIEC, Campylobacter, Yersinia, EHEC, ETEC, Vibrio, Plesiomonas, Aeromonas, diarre, gastroenterit, turistdiarre, matförgiftning
- Remiss
E-remiss Cosmic i första hand, alternativ pappersremiss Mikrobiologisk undersökning
- Remisslänk
- Anges på remiss
Utlandsvistelse. Kliniska data. Historik.
Anledning till provtagning: diarré, utredning, smittspårning eller kontroll efter tidigare påvisad anm.pliktig smitta.
Särskild frågeställning angående bakterier som inte ingår i analysen: Yersinia pseudotuberculosis, Aeromonas.
Misstanke om Kolerainfektion (Vibrio cholerae): vid fördjupad utredning av diarre efter förtäring av skaldjur eller vid klinisk misstanke.
- Provtagning/ Provtagningsmaterial
- Kommentar/ Viktigt att veta
Agens som ingår i analysen:
Campylobacter spp. (jejuni och coli)
Salmonella spp.
Shigella spp. /enteroinvasiva Escherichia coli (EIEC) Enterohemorragiska E. coli (EHEC)
Plesiomonas shigelloides
Enterotoxinbildande E. coli (ETEC)
Yersinia enterocolitica
Vibrio spp (V. vulnificus, V. parahaemolyticus och V. cholerae)
Känsligheten, framförallt för Shigella och EHEC, sjunker vid långa transporttider (mer än 24 timmar) varför det är viktigt att provet når lab snarast möjligt efter provtagning.
Upprepad provtagning kan öka känsligheten.
Vid önskemål om diagnostik avseende bakterier som inte ingår i analysen måste detta anges vid beställning, liksom om Kolera (Vibrio cholerae) misstänks, till exempel vid fördjupad utredning av diarre efter förtäring av skaldjur.
Vid gastroenterit kan analys av Parasiter (PCR) inkluderande Cryptosporidium även vara av värde. Beställ: Parasiter (PCR), F-
Vid frågeställning Clostridoides difficile beställ: Clostridoides difficile toxin, F-
Vid frågeställning jästsvamp i feces beställ: Svampodling
- Laboratoriet tillhanda
Sänd provet med nästa ordinarie transport. Kylförvaras i väntan på transport. Känsligheten sjunker med transporttiden.
- Lämnas till
Mikrobiologilaboratoriet Västerås
- Analyserande laboratorium
Västerås
- Provhantering på laboratoriet
Vid ankomst till Mikrobiologilaboratoriet överförs färsk feces till ett Fecal swab rör och lämnas till molekylärbiologi för analys snarast.
- Förvaring, hållbarhet och transport efter provhantering
Kylförvaras. Ursprungsprov och Fecal Swab sparas i kyl en vecka.
Hållbarhet i Fecal swab rör inför odling upp till 3 dygn.
- Metod och analysprincip
Molekylärbiologisk screeningmetod med PCR.
Verifiering med odling på utvalda selektiva substrat.
PCR-positiva fynd av Salmonella, Shigella/EIEC, Campylobacter, Yersinia enterocolitica och Plesiomonas shigelloides odlingsverifieras. ETEC och Vibrio spp slutsvaras efter PCR.
EHEC-positiva prov skickas till externt lab för stx-typning och försök till isolering.
Vid frågeställning Vibrio cholerae på remissen skickas prov som blir PCR-positiva för Vibrio spp. till externt lab för odling.
I de fall PCR-resultatet blir ogiltigt/ ej bedömbart utförs fecesodling avseende Salmonella, Shigella, Campylobacter och Yersinia
- Indikation/tolkning
Indikationer för provtagning är primär diagnostik vid akut diarre, utredning av diarresjukdomar samt smittspårning, uppföljning och epidemiologiska utredningar avseende tarmpatogena bakterier.
Provsvar där bakterie-DNA har påvisats med PCR men bakterieväxt inte har kunnat verifieras med kan bero på låg mängd bakterier i provet, avsaknad av levande bakterier i provet och/ eller högre känslighet i PCR-metoden.
- Ackreditering
Nej
- Biobank
Nej
- Svarstid
1-4 dagar
Prov som ankommer till lab senast 09.00 vardagar respektive 10.30 lördagar preliminärsvaras senast nästföljande vardag.
- Uppdaterad
2024-06-12
av TG
